根据经脉气血流注形象的命名：腧穴所在部是气血汇聚、转输、分流、注入之所，所以以百川汇聚而成之海；江河注入之“泽”“渊”“池”；小水汇流而成之“溪”“泉”“沟”“渠”“渎”等来命名腧穴是十分形象的。
依脏腑名称的命名：如肺俞、心俞、肝俞、脾俞、肾俞及六腑俞等；
依脏腑所藏五神的命名：五脏皆有所藏，心藏神，肺藏魄，肝藏魂，脾藏意，肾藏志。如神藏、本神、神门、魂门、魄户、意舍等。
依五脏所主五官的命名：五脏开窍于五官，肝开窍于目，心开窍于舌，脾开窍于唇四白，肺开窍于鼻，肾开窍于耳。如目窗、睛明、条口、听宫、耳门等。
依天文命名：依据天空中客观存在的日、月、星辰，以及依据天、地之名而命名的腧穴很多。如上星、日月、太白、太乙、地仓等。
依据人的劳动而造出的物件名称来命名腧穴，以建筑物形象命名者居多，如府、房、库、舍、里、堂、井、阙等；
依腧穴主治作用突出的特点而命名：如光明、迎香、哑门、承扶以及诸水穴皆治水。奇穴中的翳明、神聪、阑尾穴、胆囊穴等。

总之，不论是十四经穴，还是奇穴的命名，都有其理论根据，特异性有与穴位的位置特点、取穴方法有关的，有与穴位的功能、主治有关的，有与穴位的属性有关的，所以腧穴的分类命名直接或间接关系着每个腧穴防治疾病的功效。